MATLAB 和 Simulink 在计算生物学中的应用

对生物数据和系统进行分析、可视化和建模

计算生物学家使用 MathWorks 产品通过数据分析和数学建模功能来理解和预测生物行为。

MathWorks 产品提供了一个支持药代动力学 (PK)、生物信息学系统生物学、生物图像处理和生物统计学的集成环境。

您可以使用 MathWorks 计算生物学产品开展以下工作:

  • 对数据进行导入、分析和建模,并共享结果
  • 自动化工作流元素
  • 自定义对开发前沿研究领域创新方法非常重要的算法和工具
  • 使用久经考验并受商业支持的算法和工具

“研究人员通常只关注结果,而不是编程过程。MATLAB 能让我们在更高的抽象层次上思考,用更少的时间来开发、调试、测试和创建图表。因此,我们可以更快地获得研究成果。”

Gil Alterovitz 博士,麻省理工学院和哈佛大学

计算生物学的数据分析

MathWorks 产品为计算生物学提供了一个集成的环境,从而消除了使用单独而不兼容的工具来导入、分析和共享成果的需要。您可以:

  • 执行一系列分析,包括非线性混合效应序列微阵列进化树质谱基因本体论
  • 从多个数据源导入数据,如数据库、多种文件格式或硬件
  • 通过自动生成的 HTML 报告、数据可视化或单独的工具来共享成果
  • 并行化数据分析以减少计算时间
  • 自动化分析以实现连续过程的批处理
SimBiology

计算生物学的数学建模

MathWorks 产品为各种建模类型(如药代动力学 (PK) 和系统生物学)提供了一个统一的环境。该集成环境支持您创建和分析模型,以预测和研究生物系统的特性。SimBiology 中的图形和编程建模工具使您能够:

  • 分析和可视化外部数据,从 PK 向导中识别 PK 模型,并将模型拟合至外部数据
  • 实现反应网络来研究系统的动力学特性
  • 将 PK 等模型与生化网络相结合
  • 通过自动生成的报告共享成果